Genotyping of livestock

Hlavní oblasti zájmu představuje studium mikrosatelitů skotu (plemena české strakaté, černostrakaté, německé černostrakaté, česká červinka, polská červinka, německá červinka a kříženci českého strakatého skotu, české červinky a montbeliarda), genotypizace lokusů pro mléčné proteiny, mléčnou produkci, růstovou a reprodukční kapacitu, dědičné choroby a jiné. V LMB jsou dále vyšetřovány vybrané dědičně podmíněné choroby skotu. DNA je izolována z krve a spermatu budoucích či stávajících plemeníků (resp. býků zařazených do testace), případně krve matek býků. Co se týče plemenné příslušnosti jednotlivých zkoumaných jedinců, tak téměř 3 tvoří zástupci holštýnského skotu, u nichž je výskyt dědičných chorob největší. Dále provádíme detekci u českého strakatého skotu, v menší míře u některých masných plemen (LI, MS, CHA) a pro doplnění údajů i u českého genového zdroje - české červinky. V současné době genotypyzujeme zejména hospodářská zvířata na nosičství chorob BLAD, DUMPS, citrulinemie a také na CVM. Laboratorní analýzy jsou konkrétně zaměřeny na polymorfní kódující lokusy pro leptin, b-laktoglobulin, b-kasein, k-kasein, růstový hormon (GH), prolaktin (PRL), pituitární transkripční faktor (PIT 1), insulinu podobný růstový faktor vázající protein (IGF BP3) a pro DGAT 1. V současné době se zaměření laboratoře rozšířilo i o studium polymorfizmu genu pro prionový protein (PRNP). Metody používané k analýzám výše zmíněných kódujících lokusů a mikrosatelitních markerů zahrnují polymerázovou řetězovou reakci (PCR), polymorfizmus délky restrikčních fragmentů (RFLP) a fragmentovou analýzu na automatickém sekvenátoru ALF Express II.